SE4250078

Basic info.

  • MITE ID
  • Species
  • MITE identifier
  • Superfamily
  • Family
  • Genomic location
  • TSD
  • TIR
  • MITE_2846
  • Cajanus cajan
  • SE4250078
  • PIF/harbinger
  • To26
  • CcLG07:361719-362302
  • TTA
  • GTGTGTTTGGATGGAGAATTT

Secondary structure and sequence

TSD    TIR
5'



3' 
TTATA              A      -----       GTAATTCATTTATTTGAAGAATTTCAAATTTTTTGAGGTGAAATATCTTGTTTGGATGGAGAATTTATAAGGAATTTGAAATTCATGCATTTGTGAAATTCTTTAAAATAGTAGAATTTCAAATTCTTCAAAAAAAGCAAGAATTTGAAATTCCTCATAATTTTTTTCTTCTTATTTCACTTATATATTTTATCTTATCTCTTATCTCTTCAAGTTTTAATTATTGAATATTCAAAAATATTTTTAAAGTTATTAA
     GTGTGTTTGGATGG GAATTT     AAATGGA                                                                                                                                                                                                                                                                
     |||||||||||||| ||||||     |||||||                                                                                                                                                                                                                                                                A
     CACACAAACCTACT CTTAAA     TAAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                
ATTAC              C      ATGTT       CTTAAAATTTAAGAACCATAAACTTAATGAAACTAAAGTTAAAGATAGTAAGAATTTTATAAAACAAACCTATTCAGTTAAGTTTAAAGAGTTTAAAATTTAACAACCCAACCTATACTATTAAACTAAGATGGTACTATTTTAACTAAAATTTTTATATAAATATACAACTCTAAAAATTTAATTTAAAATATTTTTATTTATAATCGATTAAAAATTTATAAATTATTAAAATTTTTAATTATAATCTTATTAT
Get MITE sequence

MITE cluster

MITE ID MITE identifier Chr Start End
Vca-MIR1168 PmiREN020835 PmiREN020834 MIR1168 Vca-scaffold_12
Vca-MIR1168 PmiREN020835 PmiREN020834 MIR1168 Vca-scaffold_12

Closed gene

MITE ID MITE identifier Chr Start End
12 Today Pageviews

Copyright ©.   Contact us: contact@pmite.com   京ICP备2022028499号-3